Uma VPN em seu VPS cria um túnel seguro entre o cliente e o servidor.

Exemplo OpenVPN:

apt install openvpn easy-rsa -y
make-cadir ~/openvpn-ca
cd ~/openvpn-ca
./build-ca
./build-key-server servidor
./build-dh
openvpn --config server.conf

No cliente:

openvpn --config cliente.ovpn

Assim, todo tráfego entre cliente e VPS passa criptografado.